Shinichi avait enfin retrouvé sa taille mais l'histoire de l'organisation n'était pas terminé Ran était si heureuse de le revoir mais un jour Shinichi lui annonça qu'il devais repartir enquêter Ran ne voulait pas mais Shinichi refusa d'entendre raison et s'en alla en la laissant Ran fut brisée même si elle ne sortait pas ensemble.
Deux ans plus tard
Shinichi a maintenant 19 ans et il revient a Tokyo en voulant voir Ran pour lui avouer ces sentiments mais il apprend avec Horreur qu'elle est fiancé avec un autre homme Shinichi est complètement démoli et se sent brisé il s'en veut d'être partit car il avait maintenant perdu Ran. Il la revoit et Ran lui présente son fiancé Kaoru Shinichi est tout de suite jaloux il avoue même a Ran qu'il est amoureux d'elle et qu'il veut être avec elle mais elle lui répond qu'il est partit et l'a brisée et que maintenant elle était fiancé avec un homme qui ne l'abandonnerait pas. Shinichi essaye de faire pardonner et de la récupérer mais Kaoru s'en rend compte et il devient énemie avec Shinichi. Kaoru et Shinichi se battent souvent. De son coté Ran se rend compte qu'elle est toujours amoureuse de Shinichi et elle ne sait plus quoi faire , elle en parle a ses amies et ses amies sont la pour la consoler. L'affaire des hommes en noir n'est pas terminé et Shinichi ne veut plus enquêter sur eux depuis qu'il a perdu Ran mais Heiji essayent de le convaincre pour les autres enquêtes mais Shinichi refusent ça ne l'intéressent plus de résoudre des enquêtes.